北京协和医学院双一流学科有5个，名单分别为生物学、生物医学工程、临床医学、公共卫生与预防医学、药学。
| 序号 | 双一流学科名单 |
| 1 | 生物学 |
| 2 | 生物医学工程 |
| 3 | 临床医学 |
| 4 | 公共卫生与预防医学 |
| 5 | 药学 |
| 序号 | 学校名称 | 双一流建设学科 |
| 1 | 北京大学 | （自主确定建设学科并自行公布） |
| 2 | 中国人民大学 | 哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、马克思主义理论、新闻传播学、中国史、统计学、工商管理、农林经济管理、公共管理、图书情报与档案管理 |
| 3 | 清华大学 | （自主确定建设学科并自行公布） |
| 4 | 北京交通大学 | 系统科学 |
| 5 | 北京工业大学 | 土木工程 |
| 6 | 北京航空航天大学 | 力学、仪器科学与技术、材料科学与工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、交通运输工程、航空宇航科学与技术、软件工程 |
| 7 | 北京理工大学 | 物理学、材料科学与工程、控制科学与工程、兵器科学与技术 |
| 8 | 北京科技大学 | 科学技术史、材料科学与工程、冶金工程、矿业工程 |
| 9 | 北京化工大学 | 化学工程与技术 |
| 10 | 北京邮电大学 | 信息与通信工程、计算机科学与技术 |
| 11 | 中国农业大学 | 生物学、农业工程、食品科学与工程、作物学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、草学 |
| 12 | 北京林业大学 | 风景园林学、林学 |
| 13 | 北京协和医学院 | 生物学、生物医学工程、临床医学、公共卫生与预防医学、药学 |
| 14 | 北京中医药大学 | 中医学、中西医结合、中药学 |
| 15 | 北京师范大学 | 哲学、教育学、心理学、中国语言文学、外国语言文学、中国史、数学、地理学、系统科学、生态学、环境科学与工程、戏剧与影视学 |
| 16 | 首都师范大学 | 数学 |
| 17 | 北京外国语大学 | 外国语言文学 |
| 18 | 中国传媒大学 | 新闻传播学、戏剧与影视学 |
| 19 | 中央财经大学 | 应用经济学 |
| 20 | 对外经济贸易大学 | 应用经济学 |
| 21 | 外交学院 | 政治学 |
| 22 | 中国人民公安大学 | 公安学 |
| 23 | 北京体育大学 | 体育学 |
| 24 | 中央音乐学院 | 音乐与舞蹈学 |
| 25 | 中国音乐学院 | 音乐与舞蹈学 |
| 26 | 中央美术学院 | 美术学、设计学 |
| 27 | 中央戏剧学院 | 戏剧与影视学 |
| 28 | 中央民族大学 | 民族学 |
| 29 | 中国政法大学 | 法学 |
| 30 | 华北电力大学 | 电气工程 |
| 31 | 中国矿业大学（北京） | 矿业工程、安全科学与工程 |
| 32 | 中国石油大学（北京） | 地质资源与地质工程、石油与天然气工程 |
| 33 | 中国地质大学（北京） | 地质学、地质资源与地质工程 |
| 34 | 中国科学院大学 | 化学、材料科学与工程 |
北京协和医学院是国家卫生健康委员会直属、与中国医学科学院实行院校合一管理体制的全国重点大学，属于世界一流学科建设高校，入选卓越医生教育培养计划。
学校前身是美英基督教教会于1906年共同创办的协和医学堂。1912年，改称协和医学校。1917年，成立北京协和医学院。1919年，改名北京协和医科大学。1929年，更名私立北平协和医学院。1951年1月，学校由中央人民政府教育部和卫生部接管，且改名为中国协和医学院。历经传承与发展，学校先后更名为中国医科大学、中国首都医科大学和中国协和医科大学。2006年定名北京协和医学院。
