牡丹江所有大学名单，包含一本二本三本和专科学校，共7所大学。
| 序号 | 学校名称 | 主管部门 | 所在地 | 办学层次 | 备注 |
| 1 | 牡丹江医学院 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 本科 | |
| 2 | 牡丹江师范学院 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 本科 | |
| 3 | 牡丹江大学 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 专科 | |
| 4 | 黑龙江林业职业技术学院 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 专科 | |
| 5 | 黑龙江农业经济职业学院 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 专科 | |
| 6 | 黑龙江商业职业学院 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 专科 | |
| 7 | 黑龙江幼儿师范高等专科学校 | 黑龙江省 | 牡丹江市 | 专科 |
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