南京医科大学是一本，该校是国家“双一流”建设高校， 是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校。
首先，需要说明的是教育部门并没有划分南京医科大学是一本还是二本，毕业证上只有本科和专科之分，是几本只是民间的一种说法。（某大学在某省是第一批次招生的话，通常认为该大学是一本大学，在第二批次招生的话，通常认为该大学是二本大学）
根据公开信息可知：南京医科大学在江苏和全国基本上是第一批次招生，所以我们通常认为南京医科大学是一本大学。（注：自2021年开始，江苏本科一批、二批合并为本科批）
南京医科大学（Nanjing Medical University），位于江苏省南京市，是教育部、中华人民共和国国家卫生健康委员会、江苏省人民政府共建高校和江苏高水平大学建设高校，是国家“双一流”建设高校， 是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、江苏省高层次人才培养计划“333工程”培训基地，长三角医学教育联盟创始成员。
学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。
截至2022年2月，学校建有江宁校区、五台校区以及康达学院连云港校区；设有19个学院，开设25个本科专业；拥有25所附属医院和50多所教学医院；拥有博士后科研流动站6个、一级学科博士学位授权点8个、二级学科博士学位授权点54个、交叉学科博士学位授权点5个、专业博士学位授权点2个、一级学科硕士学位授权点11个、二级学科硕士学位授权点65个；有在职教职工1900多人，在校学生总数近2万人。
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