| 序号 | 学系 | 专业名称 | 学制 | 授予学位门类 |
| 1 | 语言文学系 | 汉语言文学 | 4 | 文学 |
| 2 | 语言文学系 | 广播电视学 | 4 | 文学 |
| 3 | 语言文学系 | 英语 | 4 | 文学 |
| 4 | 语言文学系 | 日语 | 4 | 文学 |
| 5 | 艺术系 | 动画 | 4 | 艺术学 |
| 6 | 艺术系 | 视觉传达设计 | 4 | 艺术学 |
| 7 | 艺术系 | 环境设计 | 4 | 艺术学 |
| 8 | 艺术系 | 产品设计 | 4 | 艺术学 |
| 9 | 理学系 | 经济统计学 | 4 | 经济学 |
| 10 | 理学系 | 应用统计学 | 4 | 理学 |
| 11 | 理学系 | 光电信息科学与工程 | 4 | 工学 |
| 12 | 理学系 | 应用心理学 | 4 | 理学 |
| 13 | 理学系 | 数字媒体技术 | 4 | 工学 |
| 14 | 理学系 | 酒店管理 | 4 | 管理学 |
| 15 | 理学系 | 自然地理与资源环境 | 4 | 理学 |
| 16 | 理学系 | 人文地理与城乡规划 | 4 | 理学 |
| 17 | 理学系 | 海洋技术 | 4 | 理学 |
| 18 | 理学系 | 行政管理 | 4 | 管理学 |
| 19 | 经管系 | 城市管理 | 4 | 管理学 |
| 20 | 经管系 | 市场营销 | 4 | 管理学 |
| 21 | 经管系 | 国际经济与贸易 | 4 | 经济学 |
| 22 | 经管系 | 会计学 | 4 | 管理学 |
| 23 | 经管系 | 物流管理 | 4 | 管理学 |
| 24 | 经管系 | 人力资源管理 | 4 | 管理学 |
| 25 | 信息科学系 | 计算机科学与技术 | 4 | 工学 |
| 26 | 信息科学系 | 软件工程 | 4 | 工学 |
| 27 | 信息科学系 | 电子信息工程 | 4 | 工学 |
| 28 | 信息科学系 | 微电子科学与工程 | 4 | 工学 |
| 29 | 信息科学系 | 集成电路设计与集成系统 | 4 | 工学 |
| 30 | 信息科学系 | 物联网工程 | 4 | 工学 |
| 31 | 机电系 | 自动化 | 4 | 工学 |
| 32 | 机电系 | 电气工程及其自动化 | 4 | 工学 |
| 33 | 机电系 | 机械工程 | 4 | 工学 |
| 34 | 交通与土木工程系 | 交通设备与控制工程 | 4 | 工学 |
| 35 | 交通与土木工程系 | 土木工程 | 4 | 工学 |
| 36 | 交通与土木工程系 | 工程管理 | 4 | 管理学 |
| 37 | 纺化系 | 纺织工程 | 4 | 工学 |
| 38 | 纺化系 | 服装设计与工程 | 4 | 工学 |
| 39 | 纺化系 | 轻化工程 | 4 | 工学 |
| 40 | 纺化系 | 服装与服饰设计 | 4 | 艺术学 |
| 41 | 纺化系 | 化学工程与工艺 | 4 | 工学 |
| 42 | 医学系 | 医学实验技术 | 4 | 理学 |
| 43 | 医学系 | 临床医学 | 5 | 医学 |
| 44 | 医学系 | 医学影像技术 | 4 | 理学 |
| 45 | 医学系 | 护理学 | 4 | 理学 |
| 46 | 医学系 | 药学 | 4 | 理学 |
| 47 | 医检系 | 医学检验技术 | 4 | 理学 |
| 48 | 医检系 | 卫生检验与检疫 | 4 | 理学 |
省级一流本科专业建设点名单：行政管理、土木工程、检验技术专业。
江苏省独立学院专业综合评估中被评为星级专业：会计学、市场营销、计算机科学与技术专业。
南通大学杏林学院是经国家教育部批准成立的本科层次独立学院。学院始建于1999年2月，前身为南通医学院杏林学院，2004年5月在原南通医学院、南通工学院和南通师范学院合并组建南通大学后，更名为南通大学杏林学院。
学院以启东校区为主体办学校园，校区坐落于经济发达的江苏省启东市高新技术产业园区，东临黄海，比邻上海，具有独特的区位优势，以建设生态式、花园式、数字式、海景式校园为目标，规划总面积近1200亩。学院医学类专业目前在崇川校区办学，崇川校区坐落于“中国近代第一城”、我国首批沿海开放城市之一的江苏省南通市。校园内鸟语花香、小桥流水、一步一景，是莘莘学子读书学习、陶冶情操、放飞梦想的理想家园。
学院围绕经济社会发展需求培养各类应用型人才，现有全日制在校本科生近12000人，设有48个专业，涵盖经济学、文学、理学、工学、医学、管理学和艺术学等七大学科门类，其中土木工程、行政管理、医学检验技术专业被评为江苏省一流本科专业，会计学、市场营销、计算机科学与技术专业在江苏省独立学院专业综合评估中被评为星级专业。
学院依托南通大学实力雄厚的师资队伍，共享母体优质的教育教学资源，充分发挥办学机制的灵活性，为经济社会发展提供有力的人才支持、智力支撑和知识贡献，在党建思政、教育教学、学生管理等方面取得了显著成绩。学院教师硕博学历占比88%，主持过国家自然科学基金青年科学基金项目、“十三五”江苏省高等学校重点教材（新编）、江苏省高等教育教改立项研究课题等省市级科研项目，在省内各级各类教学比赛中成绩优异，教育教学成果丰富。学院学生在“互联网+”大学生创新创业大赛、全国大学生英语竞赛、全国大学生工程训练综合能力竞赛、美国大学生数学建模大赛等多项比赛中屡创佳绩。
多年来，学院形成了健全的教育教学管理体系和科学的办学管理机制：
合理的培养方案??围绕培养应用型人才目标，制定适合学院学生的培养计划和课程体系。采取“因材施教、科学管理”的教学管理策略，重视学生综合素质的培养，尊重学生个性，发挥学生特长，挖掘学生潜能，积极有效地为每位杏林学子成长成才创造条件。
高效的管理机制??学院管理体系健全，运行机制灵活，拥有一支精干高效的管理队伍。建立健全一系列以人为本、科学有效的教学和学生管理制度，构建形成完整的学生自我管理、自我服务、自我教育、自我监督网络。
