以下是2016云南一本大学排名理科，根据理科一本录取平均分排名，包含部分专业在一本招生的二本大学。
| 云南一本大学排名 | 学校名称 | 录取线差 | 省市分数线 | 录取平均分 |
| 1 | 云南大学211 | 45 | 500(第一批) | 545 |
| 2 | 昆明医科大学 | 69 | 500(第一批) | 569 |
| 3 | 云南中医学院 | 46 | 500(第一批) | 546 |
| 4 | 云南财经大学 | 41 | 500(第一批) | 541 |
| 5 | 大理大学 | 40 | 500(第一批) | 540 |
| 6 | 昆明理工大学 | 20 | 500(第一批) | 520 |
| 7 | 云南师范大学 | 0 | 500(第一批) | 500 |
| 8 | 云南民族大学 | 0 | 500(第一批) | 500 |
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