清廉，是阮氏家教的核心内容。道光元年(1821年)在广东任上，阮元执掌六处官印。就在这年，他的次子阮福生下一个男孩，同僚属下，纷纷前来祝贺。对于贺礼，阮元一概拒绝。次年，孙儿抓周之日，他用红笺写下了一首诗：“翡翠珊瑚列满盘，不教尔手亦相拈。男儿立志初生日，乳饱饴甘便要廉。”在阮元家庙，这样的诗句楹联并不少见，“春风大雅能容物，秋水文章不染尘”“六子三孙满庭爱日，一琴十鼓两袖清风”，这些语重心长的文字，体现了阮氏家族对清正廉洁的自觉追求。
清廉，是阮氏家族一贯的家风。阮元的祖父官至参将，虽掌握大权，却能施以仁政;掌控着军饷，却坚持廉洁奉公，以致退休归里后，家无恒产，窘迫时，夜无贮粮。阮元的父亲阮承信，因家境贫困，放弃入仕之途。但他穷不失志，尤重子弟教育。教读“明体达用”圣贤书，劝做“当为翰林”正派人。阮元为官时，他从不因子荣自觉身贵，而是严以律己，以身作则，教子清廉。
阮元在浙江学政任上时，有老朋友来看望他父亲，赠千金为他贺寿，阮承信毫不客气斥责此人说，我生平耻于收受不义之财，所以一直贫穷。你今日为我贺寿，赠我重金，是何缘故?如果你有求我儿子，他受朝廷重恩，清廉犹不足报答，怎么可能糟蹋自己?你以礼来，我以礼相待;你以贿来，难道是想受国法制裁?一番话掷地有声，行贿者谢罪而退。
一个高尚的背影是儿女心中的一脉青山。有这样的父亲做表率，阮元的清廉不是一般的自觉，而是一种高度的自警、自爱和自尊。
他不但自己以身作则，而且从严治贪，毫不手软。杭州税关北新关官吏横行霸道，胥吏勾结为奸。阮元上任后，严格法纪，痛惩宿习。官吏中刁顽之辈不敢妄为，商贾士民车船畅通无阻。
历来赈灾多为施粥，阮元为了更好地救济灾民，改施粥为施钱粮。但又怕此法一行，贪官污吏中饱私囊。他饬令各县，将县、村、户人口，每月每户赈银、赈米数等书榜张挂，增加透明度。阮元自己还亲赴乡村僻谷核榜巡查，核毕乃去。
阮元的“廉”体现在三方面。一是治家严，这可以从他对孙儿抓周题诗、致仕后管束家人的书信当中看出来;二是治吏严，这可以从他在浙江依斗定尺、巡查浙署各个仓库亏损等中看出来;三是律己严，从他过生日茶隐一日，不买诸生的文物，可看出他对自己的要求很严。他一生在仕途五十年，但他没有建私人园林，因为他的钱多用于编书刻书上，并无余钱。所以乾隆夸他“明白老实”，嘉庆评价他“有守有为、清俭持躬”。
蹄花开处，书香弥散。家训传世，清风化雨。待到阮元的儿子阮常生为官时，时以家训自励。阮常生奉命办理宝华裕吉地工程，自己出钱租车，携同老仆住在村民土屋中，自己烧饭做菜，从不打扰乡民。他出任清河道台时，权钱在手，但巡查所辖府州时，皆是轻车简从。严冬之夜，巡查各堡，仅备用一部驿车、两匹马，两个仆人随行，宛若兄弟赶集。
阮元一生，可谓政绩生辉，文心出彩，官场敬佩，民心拥戴。这样的人生成就，不仅仅是一个人的人生彩绘，更是一个家族精神家园的纵深风景。其中，阮氏家族的家规家教是阮元的心灵支撑，为他的人生提供了富足的营养。
励志向学
阮元幼时有口吃的毛病，去私塾读书，常常受到同窗的嘲笑，老师要求也严，故而心有畏惧，不想读书。母亲了解缘故后面色凝重，厉声说，自古英才出严师……口诎、友讥，难倒你了么?来，母亲与你一同诵读。母亲的教育对阮元产生了很大影响，励志向学成了他毕生的追求。后来，他也把这种求学精神传给子孙。
“秋斋展卷一灯青，儿辈须教得此情，且向今宵探消息，东窗西户读书声。”这是某个秋夜，风清月朗，阮元听着三个儿子琅琅读书声，兴致所至，有感而发。
为了鞭策儿子苦读，他还撰写了“欢喜性生方嗜学，和平心定即修身”的楹联悬挂于塾中。“读书明体达用，徒钻时艺无益也。”对于治学方向，阮元有着清晰的认识。他让儿子阮福改学经史诗文，强调族中子弟可以不学八股不入仕，但不可无所用心、不学无术，成为饵名钓禄之徒。
不光对家族子弟有这样的治学要求，对社会青年亦有同样的倡导。他在杭州创建“诂经精舍”，在广州建立“学海堂”。在这两所具有时代气息的新型学校里，不讲八股制艺，而是开设十三经、四史、《文选》等各种专题课，指导学生掌握经学、史学、文学、数学、地理等领域的知识，还教授工程技艺等技能，培养了一大批术有专长、学有成就的青年学者。
孝亲敬长
在中华民族传统文化中，“孝悌”思想具有鲜明的儒家文化特色。身为大儒的阮元对“孝悌”思想十分推崇，《〈孝经〉解》和《曾子十篇注释》时时相随，以实际行动践行孝道。
阮元对于父辈师长总是心怀感恩。归家视亲，携礼奉献于慈父膝前;自己的生日，隐居竹林以清茶自贺，父亲的生日则邀亲朋以诗庆寿;父亲逝世后，为怀念父母，阮元写下《诰封光禄大夫户部左侍郎显考湘圃府君显妣一品夫人林夫人行状》近8000字祭文，情真意切，催人泪下。对待老师，阮元同样知恩图报。阮元外放任浙江学政时，他为当年乡试时的房师孙梅的《四六丛话》欣然作序;为报幼年业师乔椿龄之恩，阮元督学山东时，延聘于幕中，悉心照顾……阮元的一举一动皆发自内心，清廉有为、忠孝两全，被后人颂为典范。
崇学博瞻
阮元在日理万机的督抚从政之余，勤学苦读，著书立说、刊印经籍，刊印或编著了《经籍纂诂》《皇清经解》《十三经注疏校勘记》《畴人传》《宛委别藏》《?经室集》等著作3600多卷，涉及经学、哲学、语言学、金石学、史学、文学、艺术、科学技术等诸多门类。学有本原，博瞻通贯，穷极隐微，有所发明，是他的治学特点。另一方面，阮元思想开通，治学汇通。他力改空虚不实、脱离社会的学风弊病，团结一大批江浙粤的学者，由脱离现实之考据转为务实之实践，以新的价值取向，确立新的学术模式，把汉学推崇的“实事求是，推明古训”作为经学研究的宗旨和方法，尊重史实，汉宋兼采，贴近实际，强调人性化和社会公德，关注国计民生和百姓疾苦，从而成为乾嘉学派的后起之秀和集大成者。
《?经室集》
阮元还胸襟开阔，不拘一格选择人才，灵活变通培育人才。嘉庆二年(1797年)四月，身为浙江学政的阮元，在台州发现了精于天文和数学的周治平。但周因八股文做得极差，连入学当生员的资格都没有考上。阮元惜才难得，以其数学单科成绩优异，特许入学，后又招入“诂经精舍”。看到他写的文章，觉得周能够融合中西学说，其理甚明，采用其精彩文字辑入《畴人传》。阮元说，撰这本书，得周治平参校之力甚多，并以诗赠之：“中法原居西法先，何人能测九重天。谁知处士巾山下，独闭空斋画大圆。”
《畴人传》记录了37位外国的科学家，这一点非常难得。当时闭关锁国，外国的这些东西不太好介绍。但是阮元当时地位比较高，眼界也比较高，介绍了阿基米德、哥白尼，还有欧基米德这些科学家。
隋文选楼
阮元还是藏书大家。嘉庆九年(1804年)，他在家庙西侧建“隋文选楼”，以纪念扬州藉曹宪、李善两位《昭明文选》大家。其中存书2589种，所藏宋元精椠旧本、钟鼎古器若干，多为传世之宝和孤本藏书，并在每种书目下注明作者和版本流传情况，以及精当的内容提要。由于阮元为官为学为人都令人仰慕，所以“隋文选楼”一度成为文人雅士相聚的场所，接待过一大批像梁章钜、龚自珍、伊秉绶、林则徐等清代名人、学者。
