毕业证上注明中外合作办学与国内的毕业证书是有区别的，中外合作办学在没有认证的情况下与国内的证书是并不一样的，需要考生在留服中心进行认证，认证之后才相当于国内学位证书，能够证明学员具有学位能力。
中外合作办学是指外国教育机构同中国教育机构在中国境内合作举办的以中国公民为主要招生对象的教育机构。中外合作办学属于公益性事业，是中国教育事业的`组成部分。国家对中外合作办学实行扩大开放、规范办学、依法管理、促进发展的方针。国家鼓励引进外国优质教育资源的中外合作办学。中外合作办学者、中外合作办学机构的合法权益，受中国法律保护。
中外办学的毕业证两者的毕业证并没有区别，如果中外合作有出国作项目交流的话还会多一本外国院校的毕业证书。
但中外合作办学毕业与国内传统办学毕业，在培养目标、培养方式、使用教材、学费等方面还是有一些区别的：
1、培养目标的区别。与普通专科的培养目标比，中外合作办学专科招生的培养目标，更偏重于培养外向型人才。
2、培养方式的区别。普通专科招生的教学以汉语授课为主，中外合作办学专科招生的教学以英语授课为主。
3、使用教材的区别。普通专科的教学多采用国内教材，中外合作办学招生的教学多采用国外原版教材。
4、学费高低不同。中外合作办学招生的学费，一般要比普通专科招生的学费标准高。
5、中外合作分数比普通专科低，中外合作应该由外教把关，对语言方面有好处，而且有出国的机会。
6、中外合作办学，只有国内学历，没有国外学历。中外合作办学本意是根据学科需要建立的和国外院校共同开展的学科项目攻关。
