福建生物工程职业技术学院王牌重点专业有生物制药技术、康复治疗技术、中药学、药品经营与管理等,具体专业名单请参考以下整理资料。
《高等职业教育创新发展行动计划（2015?2018 年）》项目认定骨干专业：康复治疗技术、中药学、药品经营与管理
省级示范专业：生物制药技术等
全国职业院校健康服务类示范专业点：中药
| 专业 | 备注 |
| 中药学 | 省级精品专业、国家教育部、财政部、省教育厅“以奖代补”项目重点支持建设专业、教育部高等职业教育创新发展行动计划（2015-2018年）重点专业、首批全国职业院校健康服务类示范专业点 |
| 生物制药技术 | 省级示范专业 |
| 药品经营与管理 | 省级示范专业 |
| 药品生产技术 | 省级精品专业 |
| 康复治疗技术 | 教育部认定骨干专业 |
福建生物工程职业技术学院（Fujian Vocational College of Bio-engineering）是一所隶属福建省教育厅，以培养生物医药、健康食品、康复养护、医学技术、健康管理高级技术技能人才为主的公办全日制高等职业院校。
学校前身是创办于1980年5月的福建医药学校；2005年5月组建为福建生物工程职业技术学院。学校是中国医药教育协会中医药技术传承专业委员会主任委员单位、全国食药行指委技能竞赛工作委员会主任委员单位，是全国首批“现代学徒制”试点学校、“1+X”老年照护职业技能等级证书试点学校，是“金陵康复医学教育联盟”成员，是全国中医药保健服务国家标准研发及专业人才培训基地。
截至2021年6月，学校有洪山桥和铜盘2个校区。学校下设7个教学系（院、部），开设有16个高职专业。学校有教职员工258人。
